Toto je pomerne závažná chyba - pozri sa do Synapticu, ktoré balíky sú poškodeneé a odstráň ich. Zrejme si urobil tú chybu, že si nainštaloval balík z nejakého zdroja a zdroj si potom odstránil - to pre systém znamená že s balíkom je problém - nie je v žiadnom zdroji ale podľa systému si ho inštaloval z internetu (nie ručne).
Ak silou-mocou potrebuješ balíky z iných ako oficiálnych zdrojov, tak tie zdroje pridaj a nechaj tam.