Nechci tě přesvědčovat o tom, že je to špatné řešení, zvolil sis jej sám. Nicméně rozdíl mezi těmito distribucemi je pouze v tom, že klasické ubuntu využívá jako GUI Unity, zatímco Kubuntu využívá KDE. KDE samozřejmě můžeš do klasického ubuntu doinstalovat a pak si jen volit na přihlašovací obrazovce, jaké GUI chceš zrovna použít. Při tvém řešení máš zbytečnou duplikaci dat, oba systémy budeš muset aktualizovat (tzn. obět 2x tolik dat při stahování aktualizací). V případě 1 systému aktualizuješ pouze 1x.
V případě,že to máš na testování a uvažuješ, že bys ten systém svými zásahy mohl zbořit, uvažoval bych spíše o virtualizaci (tzn. nainstalovat Kubuntu do Virtualboxu)