Swap bych na první oddíl nedával. Na první oddíl bych dal /, na druhý swap na třetí /home. Bootflag pro ubuntu nedůležité, ale můžeš si ho přesunout na oddíl, kde budeš mít /, třeba přes gparted. Nevím, jak by se to ale chovalo na rozšířeném disku. Samostatný oddíl /boot bych nedával. Nechápu, proč máš /dev/sda2 jako rozšířený oddíl. I kdyby ti to fungovalo, tak možná budeš chtít někdy v budoucnu z toho nemocného disku zachraňovat data. A z rozšířeného oddílu je úspěšnost obnovení o něco horší.