Jak kdy, nekdy se ulozi ty baliky do cache, myslim ze to je "/var/cache/apt/archives", vycisti se to "apt-get clean" (odstrani vsechno) a nebo autoclean (odstrani stare)
Zalezi, nainstalovany program ti klidne muze nacpat obrazek do /var/logs, a taky je dost volny vyraz "programy" - binarky najdes vetsinou tam kam ti saha PATH (a jestli ne, tak ti to ten balicek do PATH prida), kdezto konfiguraky jsou bud v tvem home nebo v /etc, nejake blbosti muzou byt v /usr/share...
Zalezi co je u tebe uz systemova vec, kdazdeopadne to reknu takhle, vsechno v koreni (/) krom /home
dpkg