Tlačítko "Obnovit" v Synapticu má stejný "efekt" jako zadání příkazu
sudo apt-get update
T. j. obnoví (načte) veškeré zdroje které jsou přidané ve zdrojích SW.
Výše uvedený výpis znamená (W = warning = upozornění), že určité položky máš přidané vícekrát. Dokonce tam máš uvedeno kterých položek (v /etc/apt se to týká)
Aby upozornění zmizelo, je třeba tyto duplicity (jednu z těch položek) ve zdrojích SW odstranit.
Lze to udělat buď v aplikaci "Software & aktualizace" nebo ruční editací zdrojů SW.
Najdeš je ve složce
/etc/apt/sources.list.d
Příslušný soubor .list se buď smaže nebo lépe, příkaz v něm obsažený se zakomentuje (#)
Není to nic světoborného, ale určitou zkušenost to přece vyžaduje.
Ve tvém konkrétním případě bych zakomentoval přísl. položku v souboru
/etc/apt/sources.list nebo v /etc/apt/sources.list.d/xenial-partner.list
Oba soubory si porovnej a mělo by to být jasné (co (který řádek) je duplicitní).
Doporučuji si složku napřed zazálohovat.
Jestli jsi byl úspěšný poznáš po zadání příkazu
sudo apt-get update
Chybové hlášky (na konci výpisu) už se nezobrazí.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Úplně nejjednodušší je ale resetovat zdroje SW do defaultu (je tam na to tlačítko). Potom si ovšem zdroje (PPA) které sis přidával po instalaci sám musíš přidat znova. Pak ale není vyloučeno, že se problém objeví znova. Stává se to většinou právě po přidání nějakého cizího PPA s chybou/bugem..