Pokud jsi pri instalaci nedal "zapsat zmeny na disk", nemelo by se s diskem nic delat. Instalace Ubuntu na disk nic nezapisuje, dokud nevytvoris partitiony a pak das instalaci.
Jinak by ale Tvuj problem mel jit vyresit pomoci DVD s Vistama, kde das opravu systemu. (alespon v XP to tak fungovalo)