Editovať sources list (podľa tých odkazov) je vždy o držku, aspoň pre mňa je to dosť neprehľadné. Keď na mňa naposledy vyskočila podobná hláška, tak som skontroloval Zdroje softvéru a položku Ďalší softvér a naozaj som tam mal popridávané rovnaké zdroje. Po ich odstránení a následnom zaktualizovaní problém zmizol. Skúste tiež pozrieť do Zdrojov softvéru, či tam nenájdete duplicity.