Napřed se omlouvám za mistifikaci, rozšíření se ukládají do:
~/.thunderbird/hiecckna.default/extensions
Takže smazáním složky ~/.thunderbird musí dojít i ke smazání rozšíření. Tvrzení, že tam zůstaly byla moje chyba z nepozornosti.
Každopádně se mi podařilo opravit thunderbird pomocí těchto příkazů:
sudo apt-get purge thunderbird
sudo updatedb
Potom jsem smazal všechny soubory, které zbyly a obsahovaly v sobě slovo thunderbird. Potom jsem jej znova nainstaloval a naimporotval emaily. Stáhnulo se mi asi 4GB dat, což jsou všechny moje emaily, když jsem to kontroloval s thunderbird složkou z jiného PC. Poté stahování ustalo, čímž je problém vyřešen. Předtím se mi stahovalo přes 9GB dat bez toho, aniž by to chtělo ustat.