Jedna se o uplne jiny operacni system. Programy urcene pro Linux nejdou pustit na Windows a naopak. Existuji sice urcite nastroje jak nektere programy z Windows spustit v Linuxu, ale nefunguje to moc spolehlive. Pro Linux je ale k dispozici takove mnozstvi programu, ze je velmi nepravdepodobne, ze byste nenasel nahradu za vami pouzivane programy.