ffmpeg -i 'filename.mkv' -vcodec copy -acodec copy -bsf:v h264_mp4toannexb 'out_video.avi'
A proč ? AVI je zastaralý kontejner, který toho moc neumí. MKV přehraje každá televize a můžeš do toho zabalit spoustu věcí. Opravdu nevidím důvod to dělat.
sudo add-apt-repository ppa:paul-climbing/ppasudo apt-get updatesudo apt-get install winffsudo apt-get install libavcodec-extra-53
Ale musíš počítat s tím, že pokud to MKV má více zvukových nebo titulkových stop, tak to v AVI mít nebudeš.