Patrně nevíš, že gnome-software a software-center jsou dvě naprosto odlišné věci.
Zatímco to první je tzv. "nové centrum" softwaru (které stejně stojí za houby), tak to druhé je původní staré dobré software centrum.....
A můžeš mít klidně nainstalované obě dvě.
Spouštění je buďto spouštěčem v aplikacích nebo z Terminálu
software-center
respektive
gnome-software