zrovna v pripade Gaimu se to da vyresit docela snadno - staci nainstalovat balik gaim-extendedprefs
je to plugin, takze se musi aktivovat v nastaveni Gaimu, v 'zasuvnych modulech' - Extended Preferences
pak staci na stejnojmene polozce zaskrtnout 'Hide buddy list at signon'
nevim ale jak v pripade dalsich aplikaci, ale je pravdepodobne, ze existuje nejaky parametr pro minimalizaci...