Těžko říci, jaké jsou tvé schopnosti - já bych si přepsal boot sector. Stačí jen, aby byl BIOS schopen rozeznat, že USB obsahuje OS - což není tak náročné - samotné bootování stejně proběhne podle BIOS priority, či manuálně. Možná bude stačit i jen nainstalovat Windows na USB - nemám s tím zkušenosti. (Co se týče mého vlastního OS - podařilo se mi napsat univerzální boot sector.)