Osobně jsem na popsaný problém nenarazil, asi hlavně proto, že grafy v OOo používám spíš minimálně. Rychlým testem se mi problém reprodukovat taky nepodařilo (graf XY se dvěma datovými sadami a proložením, několik změn velikosti grafu). Jsem na Ubuntu 8.04 a momentálně používám OOo 3 nainstalované z balíčků ze stránek Openoffice.cz, ne z repozitářů. Pokud bys to otestoval a problém by byl jen s balíčky z repozitářů Ubuntu, doporučuju nahlásit problém na launchpad.ubuntu.com.
Jinak ale všem kdo chtějí dělat náročnější grafy (XY proložené libovolnou funkcí s výstupem základní statistiky proložení, 3D plošný graf, polární graf a další) doporučuju některý z klonů Originu. Zkoušel jsem Qtiplot, Labplot a SciDAVis. První dva jsou v repozitářích Ubuntu (nevím v kterých, mám zapnuté vše vč. multiverse), SciDAVis má ke stažení deb balík na stránkách
http://scidavis.sourceforge.net/, instalace byla bezproblémová. Pokud někdo znáte Origin, tak všecny tři jmenované programy se mu velmi blíží rozhraním a ovládáním, velmi za ním zatím zaostávají v množství analytických funkcí, nicméně na grafy jsou více než dostačující. Excel, Calc a Gnumeric se s tím vůbec nemůžou srovnávat, jsou to taky jinak (obecněji) zaměřené aplikace.