Nainstalujte si quick-lounge-applet jako quick launch, tu orientaci spuštěných aplikací jsem už někde viděl, ale jde to udělat i jiným appletem, kde se zobrazují pouze ikony spuštěných programů, bohužel si nepamatuju název ppletu.. s tray nic jiného neuděláte, než že se bude po ikonkách roztahovat vertikálně.. místo normálního gnome menu jde přiinstalovat debian menu nebo dokonce v appletech je něco podobného, kdy je nabídka programů, místa atd v jednom tlačítku..
edit:pokusil jsem se něco podobného na rychlo udělat.. Toto na obrázku je práce asi dvou minut


spodní panel si odmyslete.. nechtěl jsem svoje nastavení likvidovat

(tray tam nemám hozený, protože by se mi nezobrazoval, porotže už jej jednou mám na spodním panelu