Musíš zvážit jestli budeš mít hodně svejch dat nebo instalovat hafec programů a taky zvážit kolik máš ram a jak náročné aplikace budeš spousštět, kolik bude třeba pro swap? A když třeba i budeš přemejšlet jaké typy souborů na jakém oddílu spíše budou (hodně malých, nebo méně velkých), můžeš vést další dilema o filesystemu.
Já mam dva disky po 80 GB. Jeden celý mam rozdělený na dva oddíly, na obojích je hudba (zálohy na dvd), připojeno ke kořenu, druhý disk mam rozdělený na tři oddíly. swap, kořen a home. Je podle mě vhodně alespon logicky (a zalohovat a zalohovat) oddelit systém a uživatelská data. V Home tak budou pouze uživatelem přidaná data (plus konfiguráky a pomocné soubory programů pro invidiuální nastavení atd) a druhý samostatný oddíl pro /. V případě problému můžeš přeformátovat systém (je dobrý si třeba /etc/ zálohovat, s rozmyslem obnovovat) a data v home budou ok. A čím více menších oddílu, tím méně dat se poškodí, kdy se pokazí filesystém.