V repozitářích jsou balíky obvykle "duálně" tedy pro obě architektury. DPKG samo rozpozná jaký balík může použít a jaký ne, pokud máš balík pro 32bit a chceš ho dostat do 64bit systému, tak to lze, ale musí se to udělat ručně.
Pokud si náhodou přidáš repozitář kde nebudou balíky pro 64bit, tak se takový repozitář bude pro systém jevit jako prázdný