nebo si nainstaluj ubuntu tweak pokud nemáš a tam je pod možností scripty zvolit procházení jako root. Tam si ho přetáhneš v levo do panelu aktivních scriptů. Po uložení se ti při kliknutí pravým myšítkem na složku objevý možnost sripty a procházet jako root. Tento script je sice v 12.04 nefunkční, ale už tady byla na fóru jeho úprava, která šlape.
edit: myslím že to je tohle
#/bin/bash
p="`echo $NAUTILUS_SCRIPT_SELECTED_FILE_PATHS|sed -n '1p'`"
[ -z $p1 ] && gksu nautilus "$NAUTILUS_SCRIPT_CURRENT_URI" || gksu nautilus "$p"
Klikneš pravým na složku, rozbalíš si scripty a zvolíš možnost zobrazení scriptů. Otevře se ti složka se scripty co sys aktivoval, a jen si přepíšeš script roota codem nahoře.