Hm, 12.04.1 mám, ale ani jsem tento nestahoval, protože mi šlape na radeonu jak Unity tak Gnome-shell dobře.
Taky se mi včera stala podobná věc, ale neupravoval jsem /etc/apt/ ale smazal jsem jen ten duplikát ve /var/lib prostě ten který je v tom chybovým hlášení a zaktualizoval.