Tohle je častá chyba, zvláště pokud je dotyčný soubor na tabulce NTFS. Bohužel, tohle není chyba systému, nýbrž FS. NTFS je nedokumentovaný formát MS, který prakticky nikdo nezná, veškerá práce s tímto FS na non-MS systémech se tak odvíjí od poznatků získaných reverzním inženýrstvím. Zejména při přepisování malých bloků, pak má systém problémy posoudit, které bloky přepsat a jak, v případě, že se mu něco nezdá, celá operace se neuloží. Případně (pokud je disk s NTFS při vypnutí mountován) může dojít k jeho nekorektnímu odpojení, což může též způsobit ztrátu změn.
Řešením je vyčlenit oblast pro data a naformátovat ji na ext3 (pozor, ne ext4) a do WXP doplnit nástroj který umožní WXP s tímto FS pracovat.