ad 1) Vytvořte si skript, který budete spouštet po startu (dáte ho do sezení stejně jako předtím ty programy)
#!/bin/bash
sleep 20
gaim
a to samé s ktorrent a pak nastavíte právo na spouštění buď, že si na něj kliknete pravým a dáte povolit spouštění nebo chmod +x gaim.sh nebo ktorrent.sh podle toho jak si ten skript pojmenujete.