Nastavení myši je v /etc/X11/xorg.conf a týká se jí sekce "InputDevice" s Identifier "Configured Mouse". Nejlepší by bylo, kdybys měl zálohu xorg.conf před tím, než jsi něco instaloval, co ti pravděpodobně něco změnilo, když jsi si jistý, že HW problém to nebude.
Možná ještě omrkni ten konfigurák, jak vypadá v Mandrivě, když ti to tam funguje a porovnej je.