To, co sis ozálohoval, by ti mělo stačit. Dej si jenom pozor na to, abys při zálohování domovského adresáře okopíroval i jeho skryté podadresáře - tj. ty adresáře, které začínají tečkou a normálně se nevypisují. Mezi nimi bude i adresář .Mozilla nebo tak něco a tam jsou nastavení firefoxu. Po reinstalaci stačí jenom nakopírovat zpátky do domovského adresáře a tím by se měla nastavení obnovit - nejen Firefoxu, ale všeho...
Grub je částečně uložený v zaváděcím sektoru disku a částečně na rootovském oddílu v adresáři /boot. Aby fungoval, musíš mít obě části. To znamená, že pokud naformátuješ root, tak ti počítač už nenaběhne a skončí s nějakou chybou. Na druhou během instalace dochází vždy i k instalaci grubu (případně jeho opravě), takže se nemusíš bát, že bys o něj nějakým způsobem přišel. Při rozdělování disku v instalaci budeš muset asi vybrat ruční dělení a přes pravé tlačítko myši explicitně nastavit, že se má oddíl formátovat - ve standardním nastavení se instalátor snaží data na disku zachovat (resp. on smaže všechno kromě domovských adresářů). Na druhou stranu pokud je jediný problém to, že ti ubuntu nenaběhne, tak bych to formátování neviděl zas tak nutně - jak říkám, instalátor smaže vše kromě home a pak udělá čistou instalaci (=formátování bez nutnosti zálohovat...)