Ahoj, zadej do terminálu příkaz "mkdir ~/.gimp-2.6". Pokud to nepomůže, zkus postup popsaný v tomhle příspěvku. 
Díky, díky, díky :-) Pomohlo to, z menu i ikonou z plochy se spustí bez problému. Jen při spuštění z terminálu to ještě píše nějaké hlášky, ale zřejmě nepříliš podstatné:
milos@Pi3625:~$ gimp
(gimp:32554): GLib-WARNING **: /build/buildd/glib2.0-2.28.6/./glib/goption.c:2132: ignoring no-arg, optional-arg or filename flags (

on option of type 0
(gimp:32554): Gimp-Widgets-WARNING **: gimp_dialog_factory_dispose: stale non-toplevel entries in factory->open_dialogs
milos@Pi3625:~$
Nebo mají nějaký význam, aby bylo potřeba je řešit?