Hledám řešení abych vložil CD do mechaniky které spustí systém z USB.
Možná to nebude nutné.
Zkus vložit USB disk a potom zapnout PC, jít do BIOSU a zkusit detekovat další HDD, když se objeví, máš vyhráno, když ne, nastav pořadí zařízení pro boot takto
HDD03
HDD02
HDD01 (předpokládám, že toto je tvůj interní HDD)
Nějak jsem nepochopil, zda máš na externím disku nainstalovaný Ubuntu, nebo instalaci.
V každém případě pomůže CD SuperGrub, který vyhledá všechny dostupné bootovatelné věci a nabídne je.