chmod -R xxx slozka
1. x - vlastník (změníš přes chown -R jmeno_uzivatele slozka)
2. x - skupiny (změníš přes chgrp -R jmeno_skupiny slozka)
3. x - ostatní
(x si samozřejmě nahraď za čísla (rozsah 0-7)).
root bude mít vždy oprávnění ke všemu, co se nachází v pc.
Doufám, že jsem správně pochopil dotaz.