Nedojde k instalaci na disk D - musíš ho zmenšit, o těch 4 GiB. Ubuntu to udělá, ale buď opatrný, ať neufikneš víc, než je tam volného - pak bys mohl data ztratit.
Ubuntu si pak udělá nový oddíl (nebude mít písmenko (např. E)) a na ten se nainstaluje. Doporučuju dokonce rozdělit dále na cca 2 GiB, 2 GiB a 200 MiB. Ty první dvě udělej v EXT3 systému, poslední ve swap - a první připoj jako /, druhou jako /home.
Pokud popisu nerozumíš, spusť si grafický instalátor, myslím, že rychle pochopíš, o co jde.