Přesně to samé se mi stalo po upgradu. Jde o to, že se během instalace snad i systém ptá, co všechno chceme měnit a většinou asi odklepneme, že chceme používat ubuntí náhražku flashplayeru. Já to vyřešil odinstalací flash věcí přes Synaptic a instalací originálního balíku od Adobe.
Konkrétně odstranit Swfdec a přes stránky adobe si stáhnout balík, nebo ho najít taky v Synapticu (mám dojem, že stačí mít povoleny neoficiální zdroje ve správci). Pokud už Synaptic ukazuje, že máš Adobe player aktuální, pak pomůže odinstalace toho swfdec, který firefox tvrdohlavě používá přednostně.