Asi ani nemusíte. Systém by sa viditeľne spomaliť nemal. Aby vám potom ale nezaberali miesto na disku poťahované balíčky, tak zadajte
sudo apt-get clean all
Poprípade keby ste náhodou nejaké to spomalenie pocítili, tak myslím, že preinštalovať to až taký problém nebude. Dokonca sa mi zdá, že v Ubuntu 9.10 sú už prítomné aj nejaké nástroje.