To bude asi proto, že ConsoleKit byl nahrazen systemd-logind (na D-Bus se hlásí jako org.freedesktop.login1), který přebírá i funkce UPower. Mně momentálně ConsoleKit taky neběží, ale UPower ano. Každopádně se mi už párkrát v 13.10 stalo, že nešlo systém vypnout ani z Unity vůbec, fungovalo jen shutdown -h, což je příkaz, který stejně nakonec ConsoleKit spouštěl.
Sám to budu muset ve své aplikaci řešit, tlačítka Shutdown a Restart spoléhající na tuto službu jsou opravdu zašedlá..