Systém automaticky nerozpozná, že jeden z připojených monitorů je vypnutý, musíš ho nastavit sám. Jednoznačně je zbytečné mít monitor v systému aktivní, když ho máš vypnutý. Když už i Nvidia podporuje Randr, je nejjednodušší použít příkazu xrandr. Já jsem si napsal skript, který mi přepíná konfiguraci tří monitorů, podle potřeby a mám na to nastavené klávesové zkratky, které můžu použít i tehdy, kdy nemám obraz vůbec. Systém mi startuje se všemi monitory a následně mi skript po startu prostředí nastaví výchozí konfiguraci s aktivním hlavním monitorem. Když chci jinou, sáhnu na klávesnici, nebo dálkový ovladač.
Takový switch-monitor skript by ve tvém případě mohl vypadat cca takto:
#!/bin/sh
case $1 in
0) xrandr --output HDMI-0 --off --output DVI-D-0 --mode 1920x1200;;
1) xrandr --output HDMI-0 --mode 1920x1080 --output DVI-D-0 --off;;
2) xrandr --output HDMI-0 --mode 1920x1080 --output DVI-D-0 --mode 1920x1200 --primary;;
esac
Skript se spouští s parametry 0-2 a podle toho nastaví konfiguraci monitorů. To si můžeš upravit podle potřeby, včetně nastavení jejich vzájemné pozice (viz man xrandr).