To značí, že máš nainstalované dvě verze!? Co se takhle podívat do Synapticu?
Vyčisti nejprve ten chlívek (vč. konfigurace) a pak nainstaluj novou verzi.
V Synapticu MC vůbec nemám, spouští se asi přes Wine. ?
Takto, kdo by k***a instaloval MC přes wine, když je to oficiálně na Linux. Povol skryté položky a podívej se jestli máš složku .minecraft v home. Pokud ano, tak to znamená, že ji máš na linuxu, jinak pokud ne, tak je to přes wine, tak to bude asi jiný problém. Ještě jedna otázka, máš ho koupenej?