No, z mého pohledu můžeš (a měl bys) mít jeden adresář (tím spíš /home) pouze na jednom úložišti. Nepokoušel bych se o nic jiného, je to úplně proti zdravému rozumu.
Proč si prostě na tom novém disku nezaložíš nějaký adresář s jiným jménem než /home (nebo klidně víc adresářů) a nepoužíváš ho výhradně na data (tj. aby se třeba systém nepokoušel v něm vytvořit skryté adresáře tak, jak to běžně dělá v /home)?
Nicméně možná existuje nějaká cesta směrem raid apod., ale v tom se vůbec neangažuju a musí se vyjádřit jiní.
Osobně na dual bootu s widlemi používám NTFS disk právě jen na data, takže k nim můžou oba systémy (i když do widlí bootuju tak jednou za rok ;-) )... Tvoje výchozí situace je jiná, ale z pohledu ukládání dat může být velmi podobná.