Je to v pořádku: Protože MBR neumí víc než několik málo (tři, čtyři?) oddíly, vymyslely se "rozšířené oddíly" - oddíly, které obsahují další pododdíly.
Ty byses do MBR asi vešel, protože máš "funkční" pouze tři - linux, win a swap - ale protože při rozdělování disku dostal poslední oddíl index 5 (všimni si že sda4 chybí, asi jsi ji při manuální instalaci odstranil) tak se 5. partition do MBR nevešla a vytvořil se rozšířený oddíl sda3, který ji obsahuje.
Doufám že jsi to pochopil

A nelíbí se mi že sda3 není ukončený, gparted nic dalšího nehlásil?