Už jsem to vyřešil. Řešení je prosté. Vtip byl v tom, že já používám k nastavení všech pravidel ProFTPD serveru pomocí GproFTPD kvůli přehlednější konfigurovatelnosti serveru.
Implicitní konfigurační soubor serveru proftpd.conf je umístěn ve složce /etc/proftpd a podle něj demon proftpd pracuje. ALE GproFTPD použije tento soubor jako šablonu, tu nakonfiguruji a po ukončení ji uloží jako stejnojmenný soubor do složky /etc. A tady je ten problém, páč pokud použijem klasické
sudo /etc/init.d/proftpd start (stop či restart)
tak on načte právě ten ze složky /etc/proftpd a ten není nijak konfigurován. Hoši v tom mají hokej. Nejsnadněji jak to řešit je udělat symlink ze souboru v /etc do složky /etc/proftpd což jsem udělal a je klid. Chodí to hned jakmile zapnu Ubuntu s konfigurací, kterou mám udělanou pomocí GproFTPD přehledně a pohodlně.
Musím říci otevřeně, že linux mne mnohokrát velmi nepřijemně překvapuje. Tohle ještě pořád není pro širokou uživatelskou veřejnost.