Tak jsem na to přišel, kdyby měl někdo obdobný problém, tak se dá vyřešit takto, v nastavení klávesnice musí být v seznamu rozložení anglická kláveska na prvním místě - po té se tento problém obrátí, a naopak když to chcete s českou klaveskou, tak to tu horní číselnou řadu ignoruje v českém podání, jen y a z se prohodí správně a ostatní typické anglické znaky jako [] {} zustavaj. Snad to někomu může pomoci. Děje se to jen ve hrách v ostatních aplikacích to je v pořádku. PS.: je to jen problém v gnome.