Mám pocit, že to není jen chyba podpory systému, ale když máš fullscreen, Compiz není tak dokonalý, aby to zvládl udělat pořádně. Já osobně používám Compiz Fusion, který je na hardware sice poněkud náročnější (osobně mám 2.2GHz, 768Mb RAM a GeForce2MX 400 64Mb, rozjedu to akorát tak v pohodě). A i přes to mi funguje mnohem stabilněji, než obyčejný Compiz. Zkus si ty 3D efekty vypnout a místo nich si tam nacpat Beryl nebo právě Fusion.