Prohození Mouse 2 a 3 v adresáři ~/.fluxbuntu/keys nepomohlo.
Zůstává aktivní pouze prostřední tlačítko se seznamem ploch a aktivní panel s možnostmi nastavení panelu a hodin (tady pravé funguje normálně).
Alt + F2 nefunguje, přestože na pozadí pořád jede Ubuntu desktop (Xfce a Fluxbox mám pouze jako volby sezení).
Možnost Ctrl + Alt + F1 s přihlášením v konzoli a příkazem sudo update-menus jsem také zkusil, ale nepřineslo to žádný výsledek (zřejmě přihlášení na F1 nesouvisí s přihlášením na F9 v X).
Musím se omluvit, že nezkusím třetí možnost s grubem, ale zasahovat do spouštění systému se mi nechce, když tomu plně nerozumím. Nerad bych skončil s tím, že mi nefunguje nic. Ale díky za tip.