Měl jsem stejný problém. Soubor přepisuje program resolfconf (nebo alespoň u mne) a jelikož jsem ho nepotřeboval (DNS mám zadané ručně), resolfconf jsem jednoduše odinstaloval normálně přes Synaptic. A je klid. Jen nevím proč nefunguje nastavení přes Systém>Sítě, bylo jedno jestli jsem tam nastavil DNS ručně nebo na auto...