A je celkem možné, že bude blokován proti grafickému přihlášení v konfiguraci okenního manageru. GDM má třeba parametr AllowRoot v /etc/gdm/gdm.conf.
Další variantou je nastavit si v sudoers NOPASSWD - pak po přihlášení také máte root práva bez dotazování se na heslo (ale sudo píšete).
Nedoporučuji používat ani jedno, ale je to váš počítač a určitě máte důvod proč to chcete tak jak chcete.