Pravděpodobně to nejde. Pokud máš aliasy definované v bashrc, ty se načtou až při spuštění terminálu. Při použití Alt+F2 je systém "nezná".
Zjistil jsem dva způsoby jak to obejít:
1 Jestli se jedná o jednoduchý alias bez parametrů, je možné vytvořit symbolický odkaz, např. v /usr/bin pod rootem ln -s gnome-system-log gsl. Pak stačí použít příkaz gsl pro spuštění Systémového logu.
2 Pokud je to složitější, budeš asi muset vytvořit malý skript, třeba #! /bin/bash
gnome-system-monitor --simple nazvat ho třeba smplemon a uložit někde do $PATH, třeba /usr/bin (+nastavit práva na spuštění, chmod +x smplemon). Pak by mělo stačit v Runu zadat smplemon.
Napiš, jak to funguje.