No to tedy není normální chování. Procesor sice vytížen je, ale zpomalení by nikdy nemělo být tak dramatické.
Musíte sem ale napsat, jaký prohlížeč používáte, jinak vám nikdo nemůže poradit dostatečně cíleně.
(většinou stačí stáhnout adobe flash player pro linux a nainstalovat ho a poté zakázat ostatní interprety flashe v prohlížeči)