Takže som zistil, že to nejako súvisí s práve s Gnome. Skúšal som vo VirtualBoxe inštalovať Ubuntu cez mini iso bez gnome a nainštalovať e17 a klávesnica fungovala správne. Potom som doinštaloval Gnome a vyskytol sa opäť spomínaný problém. Bohužiaľ neviem, ktorý balík to spôsobuje, a nemám ani čas to zisťovať, ale ak by niekto vedel pomôcť, budem rád, ak pomôže.