Balíček by to mohlo odinstalovat v případě, že by byl v konfliktu s novější verzí jiného.
Příklad:
v 9.04 mohly klidně koexistovat 2 balíky na vypalování: brasero a nautilus-cd-burner. V 9.10 již byly nastaveny tak, že byly v konfliktu (někomu se tuším nelíbilo, že kontextová nabídka u CD nabízí možnost vypalování 2x, nevím o závažnějším argumentu), a tak systém automaticky odinstaloval nautilus-cd-burner. V 10.04 je situace zase podobná jako v 9.04.
Většinou má ale systém snahu o "migraci" starého nastavení na nové, takže i když nějaký balík odinstalovává, přesune jeho nastavení do nového systému (hal → udev apod.)