V GRUBu problém nebude, předpokládám, že jsi povýšil systém normálně, čímž se nainstaloval i nový GRUB, jen jsi ponechal starý konfigurační soubor. Blikání indikačních LED na klávesnici obvykle provází problémy kdy dojde k selhání nějaké funkce jádra. Ta znepokojivá hláška se týká (tahle MCU request failed, no response from hardware) síťové karty, mělo by stačit přidat kartu do blacklistu. Takže asi takto, zadej do terminálu gksudo gedit /etc/default/grub a do souboru přidej za "quiet splash" ještě tohle rt2800pci.blacklist=yes potom ulož, zavři a dej sudo update-grub