Jaký používáš přehrávač? Ve většině jde nastavit, aby bylo vždy otevřeno jen jedno okno (only allow one instance).
Taky doporučuji v Nautilu změnit v nastavení dvojklik na jednoklik pro spouštění. Je to podle mě přirozenější (i pro děcka) - okno Nautilu se pak chová jako klikání na odkazy v internetovém prohlížeči.