Tak konečně jsem to vyřešil, i když nechápu, proč se to pos..., když nikdy žádný problém nebyl.
Problém byl, že většina souborových manažerů měla problém (např. můj oblíbený Servant Salamander) s diakritikou (asi utf-8) co bylo vytvořeno, nebo editováno v linuxu. Takže postup byl takový:
1. Nainstalovat soub. manažera, který tu diakritiku "pobere" - jeden byl notoricky známý total commander, ale na vše nestačil a pak Speed Commander, kterým to šlo přejmenovat. Ostatní manažery hlásily buď nulový soubor, nebo že neexistuje.
2. V manažeru, kde k souboru není přístup (u mě např. v Servantu) jsem dal kopírovat celou složku zálohy kdekoliv jinde. To se vždy zasekne na problémovém souboru, který jsem následně ručně dohledal a přejmenoval přes Speed Commander.
Ještě před tím, jsem samozřejmě použil na odstranění diakritiky automatiku Remdiak (
http://www.pspad.com/cz/remdiak.htm), ale se vším si neporadil a já měl právě problémy s těmi "zbytky" a ty jsem odstranil tou "krkolomnou" metodou v bodě jedna a dvě.
Takže jen, kdyby třeba někdo příště měl stejný problém...