S problémem po defragmentaci disku C při nainstalování obou OS vedle sebe jsem se také setkal. Pomohlo přes live CD a program GParted odemknout swap, vymazat a naformátovat oddíl na kterém je (bylo) Ubuntu, pak na tento oddíl Ubuntu znovu nainstalovat. Aspoň u mě to zabralo. Nutno dodat, že problém se projevoval malinko jinak.