Můžeš zkusit vymazat diskovou cache: CTRL+F12 > History > Empty now. Ale myslím, že ti nezbyde nic jinýho, než smazat adresář s konfigurací:
rm -r ~/.opera
Po smazání si budeš muset nastavit Operu znova - všechno nastavení bude pryč, včetně uložených hesel atd...