A není náhodou dvakrát i ve startup applications ?
Zřejmě bude potřeba povolit skryté položky pomocí
sudo sed -i "s/NoDisplay=true/NoDisplay=false/g" /etc/xdg/autostart/*.desktop
Nebo, pokud tam je jenom jednou, zkusit jí odškrtnout a restartovat, co to udělá.